А.С. Пузанов занимается научным анализом вопросов, связанных с жилищной и социальной политикой, региональным развитием, а также развитием городов и местных сообществ.
А.С. Пузанов – один из шести учредителей некоммерческой организации Фонд «Институт экономики города» и член Правления ИЭГ.
Он принимал участие в разработке значимых правовых документов в сфере жилищной политики, включая подготовку Жилищного Кодекса Российской Федерации.
Пузанов имеет обширный опыт участия в международных проектах в России и других странах СНГ, например, в миссии Всемирного Банка в Республике Казахстан (заем на реструктуризацию экономики, 1996 г.), в проектах Всемирного Банка и АМР США «Жилищная стратегия в зоне землетрясений» в Республике Армения (1998). В качестве руководителя проекта Александр Пузанов участвовал в ряде проектов, включая реализацию программы жилищных субсидий в Российской Федерации, оказания помощи мигрантам из районов Крайнего Севера РФ и пр. Он также приглашался в качестве временного консультанта к участию в проектах АМР США и ТАСИС в России и Украине.
Александр Пузанов участвует в качестве преподавателя в обучении будущих специалистов и в переподготовке специалистов в МГУ, в НИУ–ВШЭ и других высших учебных заведениях по таким направлениям, как городская и жилищная экономика. С 2004 г. Александр Пузанов является заведующим кафедрой экономики города и муниципального управления факультета государственного и муниципального управления Высшей школы экономики, профессор Высшей школы урбанистики.